Manuel Belgrano falleció el 20 de junio de 1820 en Buenos Aires. Sus restos descansaron durante 83 años en el atrio del Convento de Santo Domingo bajo una lápida improvisada, hasta que en 1903 se inauguró un mausoleo diseñado por el escultor italiano Ettore Ximenes.
Manuel Belgrano falleció el 20 de junio de 1820 en su casa natal de la actual avenida Belgrano 430, en el barrio de Monserrat, a los 50 años. Según consta en su testamento dictado el 25 de mayo de ese año, dispuso que su cuerpo fuera enterrado en el Convento de Santo Domingo, a metros de su vivienda, amortajado con el hábito de la orden dominica.
El funeral se realizó el 27 de junio de 1820, con la asistencia de familiares y amigos íntimos. Fue sepultado en el atrio del convento, y se utilizó como lápida una placa de mármol viejo que perteneció a una cómoda de su madre, cedida por su hermano Miguel. La inscripción decía: “Aquí yace el general Belgrano”. En 1855, la placa fue reemplazada debido al desgaste causado por las pisadas de los peatones.
En 1895, estudiantes del Colegio Nacional de Buenos Aires y de la Escuela Nacional de Comercio impulsaron una campaña para construir un mausoleo en honor al prócer. Se conformó una comisión que recaudó fondos mediante suscripción pública. Aportaron legislaturas provinciales, el Ejército, la Armada, escuelas y particulares. El Congreso Nacional contribuyó mediante la ley 3363. Se reunieron 107.725 pesos.
Se abrió un concurso internacional para el diseño del mausoleo, del que resultó ganador el italiano Ettore Ximenes, autor también del busto de la República en el Salón Blanco de la Casa Rosada y del mausoleo de Francisco Muñiz.
El 4 de noviembre de 1902 se realizó la exhumación de los restos. Según una crónica del diario La Prensa, al levantar la lápida y excavar, inicialmente no se encontraron restos en la bóveda. Luego, al remover la tierra del fondo de la fosa, aparecieron algunos huesos del esqueleto, trozos de madera y clavos de bronce. Los restos fueron depositados en una bandeja de plata y colocados en una urna provisoria bajo el altar mayor de la iglesia.
El mismo diario denunció que, durante la exhumación, varios dientes en buen estado fueron tomados por el ministro del Interior, Joaquín V. González, y el ministro de Guerra, Pablo Ricchieri. La publicación exigió su devolución, y ambos funcionarios los restituyeron días después.
El mausoleo fue inaugurado el 20 de junio de 1903. La obra, de nueve metros de altura, incluye dos figuras de bronce que representan el pensamiento y la acción, bajorrelieves alusivos a las batallas de Tucumán y Salta y a la creación de la bandera, y cuatro figuras femeninas aladas que sostienen un sarcófago de aluminio. Cada una simboliza la humildad en la victoria, la educación, la vida militar y el impulso a la industria. En la parte superior, un cóndor de bronce despliega sus alas.
En la actualidad, el convento conserva marcas de balas de las invasiones inglesas, en las que Belgrano participó activamente. La inscripción del mausoleo reza: “Precursor y Fundador de la Independencia Argentina –Vencedor en Tucumán y Salta– El pueblo y el Gobierno inauguran el mausoleo a su inmortal memoria”. La Fuerza Aérea añadió una placa: “Al creador de la bandera nacional”. El Ejército sumó otra: “Creador de su gloriosa bandera”.